История Православной Церкви Чешских земель и Словакии неразрывно связана с деятельностью солунских братьев — святых равноапостольных Кирилла и Мефодия, прибывших в IX веке в Моравию (за время существования государства Великой Моравии его территория включала не только современные Чехию и Словакию, но и территории Венгрии, частей Польши и Украины) с духовной миссией.
В 863 году начинается массовое крещение местного населения. Составляется славянская азбука. Но уже в 867 году братьев вызывают в Рим: западные богословы недовольны появлением новой азбуки и возможностью богослужения на новом языке, что уменьшает влияние немецкого духовенства. Надо заметить, что это время политических и религиозных конфликтов между средневековыми правителями, Западными Папами и Восточными Патриархами, хотя официально Церковь еще едина. По возращению в Рим Кирилл и Мефодий встречаются уже с Папой Римским — Андрианом, который разрешает и утверждает богослужение на славянском языке по глаголическому обряду. Спустя несколько лет Кирилл заболевает и умирает († 869) в Риме, а Мефодий с учениками в 870 году возвращается в Блатенское княжество (территория современной Венгрии), а потом и в Моравию.